Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT42

Smim5, Small integral membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim5Q8BT42 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smim5Q8BT42 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smim5Q8BT42 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smim5Q8BT42 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smim5Q8BT42 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smim5Q8BT42 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smim5Q8BT42 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smim5Q8BT42 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smim5Q8BT42 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smim5Q8BT42 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Smim5Q8BT42 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smim5Q8BT42 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smim5Q8BT42 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smim5Q8BT42 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smim5Q8BT42 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Smim5Q8BT42 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smim5Q8BT42 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smim5Q8BT42 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Smim5Q8BT42 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Smim5Q8BT42 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smim5Q8BT42 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smim5Q8BT42 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smim5Q8BT42 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Smim5Q8BT42 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Smim5Q8BT42 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Smim5Q8BT42 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smim5Q8BT42 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smim5Q8BT42 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smim5Q8BT42 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smim5Q8BT42 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Smim5Q8BT42 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smim5Q8BT42 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smim5Q8BT42 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smim5Q8BT42 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smim5Q8BT42 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Smim5Q8BT42 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Smim5Q8BT42 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smim5Q8BT42 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smim5Q8BT42 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smim5Q8BT42 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smim5Q8BT42 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smim5Q8BT42 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Smim5Q8BT42 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smim5Q8BT42 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smim5Q8BT42 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smim5Q8BT42 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smim5Q8BT42 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smim5Q8BT42 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Smim5Q8BT42 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Smim5Q8BT42 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smim5Q8BT42 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms