Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia2Q8BSS9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia2Q8BSS9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia2Q8BSS9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia2Q8BSS9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia2Q8BSS9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfia2Q8BSS9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfia2Q8BSS9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfia2Q8BSS9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfia2Q8BSS9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia2Q8BSS9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia2Q8BSS9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfia2Q8BSS9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfia2Q8BSS9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia2Q8BSS9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia2Q8BSS9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia2Q8BSS9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfia2Q8BSS9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms