Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LsampQ8BLK3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LsampQ8BLK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LsampQ8BLK3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LsampQ8BLK3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LsampQ8BLK3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LsampQ8BLK3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LsampQ8BLK3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms