Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubgcp5Q8BKN5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubgcp5Q8BKN5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubgcp5Q8BKN5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp5Q8BKN5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tubgcp5Q8BKN5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp5Q8BKN5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp5Q8BKN5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp5Q8BKN5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp5Q8BKN5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp5Q8BKN5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp5Q8BKN5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms