Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy1Q8BIJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rufy1Q8BIJ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rufy1Q8BIJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy1Q8BIJ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy1Q8BIJ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy1Q8BIJ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms