Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe23Q8BGW3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe23Q8BGW3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe23Q8BGW3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Bhlhe23Q8BGW3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe23Q8BGW3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe23Q8BGW3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms