Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH4

Reep1, Receptor expression-enhancing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep1Q8BGH4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Reep1Q8BGH4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Reep1Q8BGH4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Reep1Q8BGH4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Reep1Q8BGH4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Reep1Q8BGH4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Reep1Q8BGH4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Reep1Q8BGH4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Reep1Q8BGH4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Reep1Q8BGH4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Reep1Q8BGH4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Reep1Q8BGH4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Reep1Q8BGH4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Reep1Q8BGH4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Reep1Q8BGH4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Reep1Q8BGH4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Reep1Q8BGH4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22,87■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Reep1Q8BGH4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Reep1Q8BGH4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22,71■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Reep1Q8BGH4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Reep1Q8BGH4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Reep1Q8BGH4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,5 ms