Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Katnb1Q8BG40 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Katnb1Q8BG40 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Katnb1Q8BG40 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Katnb1Q8BG40 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katnb1Q8BG40 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Katnb1Q8BG40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Katnb1Q8BG40 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms