Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Necab1Q8BG18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Necab1Q8BG18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Necab1Q8BG18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Necab1Q8BG18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Necab1Q8BG18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Necab1Q8BG18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Necab1Q8BG18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Necab1Q8BG18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Necab1Q8BG18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Necab1Q8BG18 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Necab1Q8BG18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Necab1Q8BG18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Necab1Q8BG18 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Necab1Q8BG18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Necab1Q8BG18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Necab1Q8BG18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Necab1Q8BG18 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Necab1Q8BG18 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Necab1Q8BG18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Necab1Q8BG18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Necab1Q8BG18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms