Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc27Q80YS5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc27Q80YS5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc27Q80YS5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc27Q80YS5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc27Q80YS5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc27Q80YS5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc27Q80YS5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc27Q80YS5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc27Q80YS5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc27Q80YS5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc27Q80YS5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc27Q80YS5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc27Q80YS5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms