Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aldh3b1Q80VQ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh3b1Q80VQ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3b1Q80VQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh3b1Q80VQ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh3b1Q80VQ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3b1Q80VQ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh3b1Q80VQ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Aldh3b1Q80VQ0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms