Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sdccag8Q80UF4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sdccag8Q80UF4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sdccag8Q80UF4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sdccag8Q80UF4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Sdccag8Q80UF4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sdccag8Q80UF4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sdccag8Q80UF4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sdccag8Q80UF4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sdccag8Q80UF4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sdccag8Q80UF4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sdccag8Q80UF4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sdccag8Q80UF4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sdccag8Q80UF4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sdccag8Q80UF4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sdccag8Q80UF4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms