Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rims3Q80U57 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rims3Q80U57 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rims3Q80U57 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rims3Q80U57 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rims3Q80U57 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rims3Q80U57 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims3Q80U57 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rims3Q80U57 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms