Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Nek5Q7TSC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Nek5Q7TSC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Nek5Q7TSC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Nek5Q7TSC3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Nek5Q7TSC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Nek5Q7TSC3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Nek5Q7TSC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Nek5Q7TSC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Nek5Q7TSC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Nek5Q7TSC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Nek5Q7TSC3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Nek5Q7TSC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Nek5Q7TSC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Nek5Q7TSC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Nek5Q7TSC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms