Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nek5Q7TSC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nek5Q7TSC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nek5Q7TSC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek5Q7TSC3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek5Q7TSC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek5Q7TSC3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek5Q7TSC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek5Q7TSC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek5Q7TSC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek5Q7TSC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek5Q7TSC3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nek5Q7TSC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek5Q7TSC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek5Q7TSC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek5Q7TSC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms