Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LnpkQ7TQ95 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LnpkQ7TQ95 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LnpkQ7TQ95 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LnpkQ7TQ95 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LnpkQ7TQ95 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LnpkQ7TQ95 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LnpkQ7TQ95 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LnpkQ7TQ95 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LnpkQ7TQ95 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LnpkQ7TQ95 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LnpkQ7TQ95 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LnpkQ7TQ95 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LnpkQ7TQ95 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LnpkQ7TQ95 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LnpkQ7TQ95 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LnpkQ7TQ95 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LnpkQ7TQ95 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LnpkQ7TQ95 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LnpkQ7TQ95 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LnpkQ7TQ95 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LnpkQ7TQ95 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LnpkQ7TQ95 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LnpkQ7TQ95 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LnpkQ7TQ95 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LnpkQ7TQ95 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LnpkQ7TQ95 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LnpkQ7TQ95 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LnpkQ7TQ95 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms