Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY9

Ldoc1, Protein LDOC1, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldoc1Q7TPY9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldoc1Q7TPY9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ldoc1Q7TPY9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldoc1Q7TPY9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ldoc1Q7TPY9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ldoc1Q7TPY9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ldoc1Q7TPY9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ldoc1Q7TPY9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ldoc1Q7TPY9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ldoc1Q7TPY9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ldoc1Q7TPY9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ldoc1Q7TPY9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldoc1Q7TPY9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldoc1Q7TPY9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldoc1Q7TPY9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ldoc1Q7TPY9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ldoc1Q7TPY9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ldoc1Q7TPY9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ldoc1Q7TPY9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ldoc1Q7TPY9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ldoc1Q7TPY9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ldoc1Q7TPY9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ldoc1Q7TPY9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ldoc1Q7TPY9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ldoc1Q7TPY9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms