Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Letm2Q7TNU7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Letm2Q7TNU7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Letm2Q7TNU7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Letm2Q7TNU7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Letm2Q7TNU7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Letm2Q7TNU7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Letm2Q7TNU7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms