Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNP2

Ppp2r1b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r1bQ7TNP2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r1bQ7TNP2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r1bQ7TNP2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp2r1bQ7TNP2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp2r1bQ7TNP2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp2r1bQ7TNP2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp2r1bQ7TNP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp2r1bQ7TNP2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp2r1bQ7TNP2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp2r1bQ7TNP2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp2r1bQ7TNP2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp2r1bQ7TNP2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp2r1bQ7TNP2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp2r1bQ7TNP2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp2r1bQ7TNP2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp2r1bQ7TNP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms