Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim46Q7TNM2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim46Q7TNM2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim46Q7TNM2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim46Q7TNM2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim46Q7TNM2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim46Q7TNM2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim46Q7TNM2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms