Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smap2Q7TN29 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smap2Q7TN29 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smap2Q7TN29 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smap2Q7TN29 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smap2Q7TN29 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smap2Q7TN29 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smap2Q7TN29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smap2Q7TN29 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms