Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScocQ78YZ6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ScocQ78YZ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ScocQ78YZ6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScocQ78YZ6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ScocQ78YZ6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScocQ78YZ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScocQ78YZ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms