Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Pdcl2Q78Y63 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcl2Q78Y63 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl2Q78Y63 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl2Q78Y63 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcl2Q78Y63 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcl2Q78Y63 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcl2Q78Y63 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdcl2Q78Y63 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdcl2Q78Y63 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdcl2Q78Y63 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdcl2Q78Y63 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdcl2Q78Y63 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcl2Q78Y63 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcl2Q78Y63 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcl2Q78Y63 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcl2Q78Y63 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcl2Q78Y63 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcl2Q78Y63 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcl2Q78Y63 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms