Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snd1Q78PY7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snd1Q78PY7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Snd1Q78PY7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snd1Q78PY7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snd1Q78PY7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snd1Q78PY7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snd1Q78PY7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Snd1Q78PY7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms