Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Sned1Q70E20 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Sned1Q70E20 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sned1Q70E20 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Sned1Q70E20 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Sned1Q70E20 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Sned1Q70E20 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Sned1Q70E20 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Sned1Q70E20 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Sned1Q70E20 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,32■■■□□ 2,61
Sned1Q70E20 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31,26■■■□□ 2,6
Sned1Q70E20 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Sned1Q70E20 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Sned1Q70E20 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Sned1Q70E20 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Sned1Q70E20 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Sned1Q70E20 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Sned1Q70E20 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Sned1Q70E20 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Sned1Q70E20 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Sned1Q70E20 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Sned1Q70E20 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Sned1Q70E20 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Sned1Q70E20 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Sned1Q70E20 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sned1Q70E20 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sned1Q70E20 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,57
Sned1Q70E20 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Sned1Q70E20 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sned1Q70E20 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Sned1Q70E20 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Sned1Q70E20 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Sned1Q70E20 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Sned1Q70E20 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Sned1Q70E20 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Sned1Q70E20 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,8 ms