Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cand1Q6ZQ38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cand1Q6ZQ38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cand1Q6ZQ38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cand1Q6ZQ38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cand1Q6ZQ38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cand1Q6ZQ38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cand1Q6ZQ38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cand1Q6ZQ38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms