Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chsy1Q6ZQ11 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chsy1Q6ZQ11 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chsy1Q6ZQ11 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chsy1Q6ZQ11 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chsy1Q6ZQ11 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chsy1Q6ZQ11 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chsy1Q6ZQ11 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chsy1Q6ZQ11 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chsy1Q6ZQ11 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chsy1Q6ZQ11 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chsy1Q6ZQ11 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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