Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl9Q6ZPT1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl9Q6ZPT1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl9Q6ZPT1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl9Q6ZPT1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhl9Q6ZPT1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhl9Q6ZPT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl9Q6ZPT1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl9Q6ZPT1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl9Q6ZPT1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl9Q6ZPT1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl9Q6ZPT1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl9Q6ZPT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl9Q6ZPT1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl9Q6ZPT1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl9Q6ZPT1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl9Q6ZPT1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms