Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smpd4Q6ZPR5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smpd4Q6ZPR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd4Q6ZPR5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd4Q6ZPR5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd4Q6ZPR5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.1 ms