Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ssx9Q6XAS3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssx9Q6XAS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssx9Q6XAS3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssx9Q6XAS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ssx9Q6XAS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssx9Q6XAS3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssx9Q6XAS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssx9Q6XAS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms