Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H2-M2Q6W9L1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M2Q6W9L1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M2Q6W9L1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M2Q6W9L1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M2Q6W9L1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms