Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CenpeQ6RT24 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenpeQ6RT24 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpeQ6RT24 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpeQ6RT24 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CenpeQ6RT24 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpeQ6RT24 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpeQ6RT24 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpeQ6RT24 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms