Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rhbdf1Q6PIX5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rhbdf1Q6PIX5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rhbdf1Q6PIX5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rhbdf1Q6PIX5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rhbdf1Q6PIX5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rhbdf1Q6PIX5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rhbdf1Q6PIX5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rhbdf1Q6PIX5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdf1Q6PIX5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rhbdf1Q6PIX5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rhbdf1Q6PIX5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rhbdf1Q6PIX5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rhbdf1Q6PIX5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rhbdf1Q6PIX5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rhbdf1Q6PIX5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rhbdf1Q6PIX5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rhbdf1Q6PIX5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rhbdf1Q6PIX5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rhbdf1Q6PIX5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms