Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx13Q6PHS6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snx13Q6PHS6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx13Q6PHS6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Snx13Q6PHS6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Snx13Q6PHS6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snx13Q6PHS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx13Q6PHS6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snx13Q6PHS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx13Q6PHS6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms