Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HjurpQ6PG16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HjurpQ6PG16 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HjurpQ6PG16 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HjurpQ6PG16 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HjurpQ6PG16 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HjurpQ6PG16 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HjurpQ6PG16 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms