Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc82Q6PG04 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc82Q6PG04 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc82Q6PG04 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc82Q6PG04 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc82Q6PG04 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc82Q6PG04 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc82Q6PG04 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc82Q6PG04 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc82Q6PG04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc82Q6PG04 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc82Q6PG04 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc82Q6PG04 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc82Q6PG04 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc82Q6PG04 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc82Q6PG04 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc82Q6PG04 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc82Q6PG04 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc82Q6PG04 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc82Q6PG04 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc82Q6PG04 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc82Q6PG04 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc82Q6PG04 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms