Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RimklaQ6PFX8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RimklaQ6PFX8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RimklaQ6PFX8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RimklaQ6PFX8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RimklaQ6PFX8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RimklaQ6PFX8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RimklaQ6PFX8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RimklaQ6PFX8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms