Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad54bQ6PFE3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad54bQ6PFE3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad54bQ6PFE3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad54bQ6PFE3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rad54bQ6PFE3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad54bQ6PFE3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad54bQ6PFE3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad54bQ6PFE3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rad54bQ6PFE3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rad54bQ6PFE3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad54bQ6PFE3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad54bQ6PFE3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad54bQ6PFE3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms