Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo4Q6PAQ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo4Q6PAQ4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rexo4Q6PAQ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rexo4Q6PAQ4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rexo4Q6PAQ4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rexo4Q6PAQ4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo4Q6PAQ4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms