Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smchd1Q6P5D8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smchd1Q6P5D8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smchd1Q6P5D8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smchd1Q6P5D8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smchd1Q6P5D8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Smchd1Q6P5D8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smchd1Q6P5D8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Smchd1Q6P5D8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smchd1Q6P5D8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smchd1Q6P5D8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smchd1Q6P5D8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smchd1Q6P5D8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smchd1Q6P5D8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smchd1Q6P5D8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smchd1Q6P5D8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smchd1Q6P5D8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Smchd1Q6P5D8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smchd1Q6P5D8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Smchd1Q6P5D8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smchd1Q6P5D8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smchd1Q6P5D8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Smchd1Q6P5D8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smchd1Q6P5D8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smchd1Q6P5D8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smchd1Q6P5D8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smchd1Q6P5D8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smchd1Q6P5D8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smchd1Q6P5D8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Smchd1Q6P5D8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smchd1Q6P5D8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smchd1Q6P5D8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smchd1Q6P5D8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smchd1Q6P5D8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms