Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpbp1l1Q6NZP2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gpbp1l1Q6NZP2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gpbp1l1Q6NZP2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gpbp1l1Q6NZP2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpbp1l1Q6NZP2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gpbp1l1Q6NZP2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gpbp1l1Q6NZP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Gpbp1l1Q6NZP2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms