Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf9bQ6NZA9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf9bQ6NZA9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf9bQ6NZA9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf9bQ6NZA9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf9bQ6NZA9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf9bQ6NZA9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf9bQ6NZA9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf9bQ6NZA9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms