Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSV7

Fam149b1, Protein FAM149B1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam149b1Q6NSV7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam149b1Q6NSV7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam149b1Q6NSV7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Fam149b1Q6NSV7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam149b1Q6NSV7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam149b1Q6NSV7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam149b1Q6NSV7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fam149b1Q6NSV7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam149b1Q6NSV7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam149b1Q6NSV7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam149b1Q6NSV7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam149b1Q6NSV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam149b1Q6NSV7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam149b1Q6NSV7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam149b1Q6NSV7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam149b1Q6NSV7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam149b1Q6NSV7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam149b1Q6NSV7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam149b1Q6NSV7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam149b1Q6NSV7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam149b1Q6NSV7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam149b1Q6NSV7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam149b1Q6NSV7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam149b1Q6NSV7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam149b1Q6NSV7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms