Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn11Q6J756 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn11Q6J756 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn11Q6J756 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn11Q6J756 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn11Q6J756 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn11Q6J756 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn11Q6J756 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn11Q6J756 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn11Q6J756 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn11Q6J756 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn11Q6J756 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn11Q6J756 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn11Q6J756 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn11Q6J756 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn11Q6J756 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn11Q6J756 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn11Q6J756 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms