Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KdsrQ6GV12 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KdsrQ6GV12 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KdsrQ6GV12 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KdsrQ6GV12 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KdsrQ6GV12 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KdsrQ6GV12 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KdsrQ6GV12 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KdsrQ6GV12 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms