Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q6DFW0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q6DFW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q6DFW0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q6DFW0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q6DFW0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q6DFW0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q6DFW0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q6DFW0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q6DFW0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q6DFW0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q6DFW0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q6DFW0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q6DFW0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q6DFW0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q6DFW0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Q6DFW0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q6DFW0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q6DFW0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q6DFW0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Q6DFW0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q6DFW0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q6DFW0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q6DFW0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q6DFW0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q6DFW0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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