Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp7Q6A4J8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp7Q6A4J8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp7Q6A4J8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp7Q6A4J8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp7Q6A4J8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp7Q6A4J8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp7Q6A4J8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms