Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd1cQ69ZK6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd1cQ69ZK6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Jmjd1cQ69ZK6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Jmjd1cQ69ZK6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Jmjd1cQ69ZK6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd1cQ69ZK6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd1cQ69ZK6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd1cQ69ZK6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms