Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF6

Git1, ARF GTPase-activating protein GIT1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Git1Q68FF6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Git1Q68FF6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Git1Q68FF6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Git1Q68FF6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Git1Q68FF6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Git1Q68FF6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Git1Q68FF6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Git1Q68FF6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Git1Q68FF6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Git1Q68FF6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Git1Q68FF6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Git1Q68FF6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Git1Q68FF6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Git1Q68FF6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Git1Q68FF6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Git1Q68FF6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Git1Q68FF6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Git1Q68FF6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Git1Q68FF6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms