Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CltcQ68FD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CltcQ68FD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CltcQ68FD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CltcQ68FD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CltcQ68FD5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CltcQ68FD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CltcQ68FD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CltcQ68FD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CltcQ68FD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CltcQ68FD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CltcQ68FD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CltcQ68FD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CltcQ68FD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CltcQ68FD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CltcQ68FD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CltcQ68FD5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CltcQ68FD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CltcQ68FD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CltcQ68FD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CltcQ68FD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CltcQ68FD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CltcQ68FD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CltcQ68FD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CltcQ68FD5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CltcQ68FD5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CltcQ68FD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CltcQ68FD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CltcQ68FD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CltcQ68FD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CltcQ68FD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CltcQ68FD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CltcQ68FD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CltcQ68FD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CltcQ68FD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CltcQ68FD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CltcQ68FD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CltcQ68FD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CltcQ68FD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CltcQ68FD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CltcQ68FD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CltcQ68FD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CltcQ68FD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CltcQ68FD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CltcQ68FD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CltcQ68FD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CltcQ68FD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CltcQ68FD5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CltcQ68FD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CltcQ68FD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
CltcQ68FD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CltcQ68FD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CltcQ68FD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CltcQ68FD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CltcQ68FD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CltcQ68FD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms