Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec4b2Q67DU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec4b2Q67DU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec4b2Q67DU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec4b2Q67DU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clec4b2Q67DU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clec4b2Q67DU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clec4b2Q67DU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec4b2Q67DU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec4b2Q67DU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clec4b2Q67DU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clec4b2Q67DU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clec4b2Q67DU8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms